Nos 60 km2 do território do PAVT conserva-se uma biodiversidade extraordinária, fruto tanto da exploração equilibrada do meio pelas populações como da sua localização na transição entre as regiões biogeográficas Eurosiberiana e Mediterrânica.

Entre 2010 e 2013 realizaram-se os inventários da Fauna e da Flora, publicando-se os respetivos Atlas. Em 2018 publicou-se também um Guia do Pesquisador da Fauna.

O estudo da comunidade de cágados de carapaça estriada (Emys orbicularis) existente no PAVT, considerada a maior do país, foi objeto de investigação aprofundada, dando origem à publicação de uma monografia sobre a sua estrutura, dinâmica, padrões de movimentação e corredores ecológicos.

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